TY - RPRT TI - Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions AU - Mason, Kaishu AU - Sathe, Anuja AU - Hess, Paul R. AU - Rong, Jiazhen AU - Wu, Chi-Yun AU - Furth, Emma AU - Susztak, Katalin AU - Levinsohn, Jonathan AU - Ji, Hanlee P. AU - Zhang, Nancy PY - 2024 DO - 10.1186/s13059-023-03159-6 UR - https://www.osti.gov/biblio/2471927 ID - 2471927 ER -